Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALS2CR12Q96Q35 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms