Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
JSRP1Q96MG2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms