Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM227BQ96M60 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM227BQ96M60 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms