Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC17Q96LX7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms