Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms