Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EP400Q96L91 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EP400Q96L91 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EP400Q96L91 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms