Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGBD1Q96JS3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms