Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DCHS1Q96JQ0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms