Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHDQ96IW2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHDQ96IW2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms