Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MRPL53Q96EL3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MRPL53Q96EL3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms