Protein–RNA interactions for Protein: Q96A58

RERG, Ras-related and estrogen-regulated growth inhibitor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERGQ96A58 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RERGQ96A58 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms