Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF3C6Q969F1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF3C6Q969F1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms