Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CELF1Q92879 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CELF1Q92879 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms