Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA4DQ92854 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA4DQ92854 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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