Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RUFY2Q8WXA3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUFY2Q8WXA3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms