Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGBL3Q8NEM8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
AGBL3Q8NEM8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms