Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP38Q8NB14 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP38Q8NB14 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms