Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC155Q8N6L0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms