Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms