Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC50Q8IVM0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms