Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP4Q86YS3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP4Q86YS3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
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