Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIBP1Q86W92 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms