Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNMB4Q86W47 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB4Q86W47 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms