Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LCA5Q86VQ0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LCA5Q86VQ0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms