Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RBBP6Q7Z6E9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms