Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q7L0L9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q7L0L9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q7L0L9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q7L0L9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q7L0L9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q7L0L9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q7L0L9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q7L0L9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q7L0L9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q7L0L9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q7L0L9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q7L0L9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q7L0L9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q7L0L9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q7L0L9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q7L0L9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Q7L0L9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q7L0L9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q7L0L9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q7L0L9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q7L0L9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q7L0L9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q7L0L9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q7L0L9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q7L0L9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q7L0L9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q7L0L9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q7L0L9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q7L0L9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q7L0L9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q7L0L9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q7L0L9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q7L0L9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q7L0L9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q7L0L9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q7L0L9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q7L0L9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q7L0L9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q7L0L9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q7L0L9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q7L0L9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q7L0L9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q7L0L9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q7L0L9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q7L0L9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q7L0L9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q7L0L9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q7L0L9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q7L0L9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q7L0L9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q7L0L9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q7L0L9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q7L0L9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Q7L0L9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q7L0L9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q7L0L9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Q7L0L9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
Q7L0L9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q7L0L9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q7L0L9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q7L0L9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q7L0L9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q7L0L9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q7L0L9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q7L0L9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Q7L0L9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
Q7L0L9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q7L0L9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q7L0L9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q7L0L9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q7L0L9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q7L0L9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q7L0L9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q7L0L9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q7L0L9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Q7L0L9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q7L0L9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q7L0L9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q7L0L9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Q7L0L9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q7L0L9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q7L0L9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q7L0L9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q7L0L9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Q7L0L9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q7L0L9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q7L0L9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q7L0L9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q7L0L9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Q7L0L9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q7L0L9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q7L0L9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Q7L0L9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q7L0L9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q7L0L9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q7L0L9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q7L0L9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q7L0L9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q7L0L9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms