Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM72Q6ZMU5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM72Q6ZMU5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms