Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDZRN4Q6ZMN7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZRN4Q6ZMN7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms