Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTC41PQ6P2S7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC41PQ6P2S7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms