Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGMBQ6NW40 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms