Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TRNP1Q6NT89 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRNP1Q6NT89 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms