Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNS3Q68CZ2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNS3Q68CZ2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms