Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CREB3L3Q68CJ9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms