Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF38BQ5VTL8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF38BQ5VTL8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms