Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDGFL1Q5TGJ6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDGFL1Q5TGJ6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms