Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC27A3Q5K4L6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A3Q5K4L6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms