Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TDRD12Q587J7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TDRD12Q587J7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms