Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms