Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDCCQ504Y2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms