Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTXN3Q4LDR2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTXN3Q4LDR2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms