Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CERKLQ49MI3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms