Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF1Q3BBV0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF1Q3BBV0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms