Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HFEQ30201 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HFEQ30201 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HFEQ30201 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HFEQ30201 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HFEQ30201 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HFEQ30201 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HFEQ30201 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HFEQ30201 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HFEQ30201 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HFEQ30201 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HFEQ30201 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HFEQ30201 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HFEQ30201 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HFEQ30201 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HFEQ30201 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HFEQ30201 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HFEQ30201 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HFEQ30201 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HFEQ30201 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HFEQ30201 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HFEQ30201 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HFEQ30201 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HFEQ30201 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HFEQ30201 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HFEQ30201 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HFEQ30201 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HFEQ30201 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HFEQ30201 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HFEQ30201 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HFEQ30201 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HFEQ30201 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HFEQ30201 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HFEQ30201 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HFEQ30201 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HFEQ30201 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HFEQ30201 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HFEQ30201 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HFEQ30201 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HFEQ30201 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HFEQ30201 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HFEQ30201 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HFEQ30201 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HFEQ30201 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HFEQ30201 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms