Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C17orf58Q2M2W7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C17orf58Q2M2W7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms