Protein–RNA interactions for Protein: Q15846

CLUL1, Clusterin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUL1Q15846 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUL1Q15846 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUL1Q15846 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUL1Q15846 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUL1Q15846 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUL1Q15846 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUL1Q15846 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUL1Q15846 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUL1Q15846 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUL1Q15846 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUL1Q15846 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUL1Q15846 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLUL1Q15846 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLUL1Q15846 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms