Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MED1Q15648 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MED1Q15648 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MED1Q15648 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MED1Q15648 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MED1Q15648 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MED1Q15648 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MED1Q15648 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MED1Q15648 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MED1Q15648 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MED1Q15648 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MED1Q15648 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MED1Q15648 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MED1Q15648 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MED1Q15648 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MED1Q15648 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MED1Q15648 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MED1Q15648 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MED1Q15648 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MED1Q15648 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MED1Q15648 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MED1Q15648 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MED1Q15648 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MED1Q15648 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MED1Q15648 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MED1Q15648 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MED1Q15648 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MED1Q15648 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MED1Q15648 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MED1Q15648 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MED1Q15648 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MED1Q15648 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MED1Q15648 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MED1Q15648 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MED1Q15648 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MED1Q15648 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MED1Q15648 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MED1Q15648 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MED1Q15648 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MED1Q15648 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MED1Q15648 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MED1Q15648 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MED1Q15648 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MED1Q15648 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MED1Q15648 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MED1Q15648 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MED1Q15648 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MED1Q15648 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MED1Q15648 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MED1Q15648 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MED1Q15648 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MED1Q15648 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MED1Q15648 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MED1Q15648 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MED1Q15648 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MED1Q15648 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MED1Q15648 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MED1Q15648 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MED1Q15648 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MED1Q15648 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MED1Q15648 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MED1Q15648 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MED1Q15648 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MED1Q15648 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MED1Q15648 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MED1Q15648 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MED1Q15648 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MED1Q15648 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MED1Q15648 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MED1Q15648 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MED1Q15648 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MED1Q15648 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MED1Q15648 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MED1Q15648 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MED1Q15648 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MED1Q15648 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MED1Q15648 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MED1Q15648 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MED1Q15648 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MED1Q15648 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MED1Q15648 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MED1Q15648 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MED1Q15648 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MED1Q15648 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MED1Q15648 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MED1Q15648 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MED1Q15648 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MED1Q15648 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MED1Q15648 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MED1Q15648 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MED1Q15648 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MED1Q15648 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MED1Q15648 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MED1Q15648 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MED1Q15648 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MED1Q15648 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MED1Q15648 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MED1Q15648 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MED1Q15648 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MED1Q15648 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms