Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF1AQ15573 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF1AQ15573 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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