Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDSNQ15517 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDSNQ15517 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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