Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYTH1Q15438 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYTH1Q15438 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms