Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDGFRLQ15198 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDGFRLQ15198 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
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